根据提供的资料，JAXA（日本宇宙航空研究开发机构）在国际空间站 Kibo 模块上开展了多项生物技术实验，但并未直接提及针对黄瓜种子的太空诱变育种或微重力对根系形态建成影响的特定对比实验项目。
资料显示，Kibo 模块支持多种利用主题，包括空间医学、空间探索、教育活动等。在生物与技术类别中，有已完成的项目如“太空胚胎”（哺乳动物早期胚胎发生）、“神经血管与器官网络”等研究，以及“小鼠栖息单元技术验证”。这些项目展示了 Kibo 模块在微重力环境下进行生物学研究的潜力。
对于读者关于如何利用 Kibo 模块开展黄瓜种子实验的问题，资料表明 JAXA 设有亚洲利用办公室（KUOA），并曾推出面向亚洲的太空种子计划（SSAF）及“尝试零重力”等教育科学实验。然而，具体到黄瓜种子的诱变育种或根系发育机制研究，当前提供的文本中未包含相关实验的具体方案、时间表或已完成的成果数据。
因此，基于现有资料，无法直接回答如何具体开展此类黄瓜种子实验的操作细节，因为资料仅确认了 Kibo 模块具备进行微重力生物学实验的通用能力，以及存在相关的亚洲合作框架，但未提供针对黄瓜这一特定作物的实验执行指南或最新研究进展。如需开展此类研究，需参考 JAXA 关于 Kibo 利用策略、设施申请流程及生物技术类别的实验申报要求，并结合其过往在植物微重力研究（如拟南芥等模式植物）中的经验进行设计。